New Mexico adalah salah satu produsen cabai (Capsicum spp.) terbesar di Amerika Serikat, dengan produksi 51,000 ton pada tahun 2021 dari area seluas 8500 hektar dengan produktivitas rata-rata 6 ton/ hektar menurut Departemen Pertanian Nasional AS Dinas Statistik Pertanian. Produktivitas rata-rata menurun sebesar 25% karena area yang ditanami untuk produksi cabai tetap sama. Hal ini mengakibatkan penurunan aktivitas ekonomi hampir 10% pada tahun 2020 dibandingkan dengan tahun sebelumnya, dari $50.1 juta menjadi $44.9 juta. Penurunan yang signifikan dalam total produksi cabai di negara bagian ini mendorong para ilmuwan untuk melakukan upaya modernisasi baru yang bertujuan untuk mempercepat perolehan genetik dan meningkatkan produktivitas dalam program Pemuliaan dan Genetika Lada Chili NMSU dengan mengevaluasi berbagai sifat yang terkait dengan hasil dan potensi hasil menggunakan tinggi alat fenotipe throughput seperti Tomato Analyzer (TA).
Arsitektur buah dan ciri-ciri yang berhubungan dengan morfologi adalah salah satu penentu keanekaragaman buah dan merupakan kontributor utama untuk hasil dan potensi hasil cabai. Dengan menggunakan perangkat lunak TA, para ilmuwan mengumpulkan data tentang serangkaian atribut buah termasuk keliling buah, indeks bentuk, ukuran, dan asimetri dalam kumpulan garis cabai beragam yang dievaluasi di bawah kondisi pertumbuhan New Mexico.
Peneliti bertujuan untuk mengkarakterisasi 105 genotipe panel keragaman Capsicum yang terdiri dari kultivar, galur pemuliaan, ras darat, dan spesies liar milik 12 jenis polong (buah) yang berbeda, untuk 32 deskriptor TA morfometrik. Analisis klaster hierarkis mengelompokkan genotipe menjadi delapan klaster berdasarkan deskriptor TA. Pengukuran dasar — yaitu, keliling, luas, lebar tengah tinggi, lebar maksimum, tinggi tengah lebar, tinggi maksimum, dan tinggi melengkung — adalah deskriptor yang paling membedakan dengan kontribusi maksimum pada keseluruhan bentuk buah.
Kegunaan deskriptor TA morfometrik, yang sulit diukur melalui fenotipe konvensional, ditunjukkan. Beberapa kultivar dengan bentuk dan morfologi buah yang diinginkan berdasarkan analisis kluster direkomendasikan sebagai tetua untuk hibridisasi guna meningkatkan hasil dalam program pemuliaan cabai. Hasil menggunakan TA untuk mengukur sifat terkait buah akan memberikan dasar untuk studi asosiasi genom-lebar dan seleksi genom untuk hasil dan sifat yang berkontribusi pada hasil dalam cabai New Mexico.